因教長蔣偉寧下台，引發各界對學術審查機制的抨擊，行政院長江宜樺17日在行政院院會上特別指出，我國大學評鑑與教師評鑑制度近年來已經變相讓學校與教師只重視論文數量。江揆要求教育部與科技部必須全面檢討學術審查制度。科技部目前研議擬定「論文掛名原則」，以杜絕掛名浮濫現象；教育部則會先了解各校制度，從行政督導著手。
江揆表示，學術界為了公平的審查，引進國外的SCI和SSCI評鑑制度，也創造台灣版的TSCI及TSSCI。但近年來有不少人開始對此制度產生疑慮，認為恐變相鼓勵研究機構與學校只重視論文的數量而非品質，且不重視教學，還有商業團體竟開始兜售論文，甚至導致研究團隊主持人或指導教授剝削學生的研究成果，使很多學生無法順利畢業，或成為廉價勞力。
江宜樺要求教育部、科技部與學術界共同討論、蒐集各方意見、全面檢討，改正目前存在的流弊及負面作用，讓教學與學術本質能夠真實呈現。
教育部高教司司長黃雯玲受訪時表示，將會針對行政院的要求做出檢討，由於教育部沒有相關的論文初審制度，因此目前規劃會先了解各校的制度，並要求各校論文要質與量並重，並從行政督導著手，尚不會牽涉到修法。
科技部也將擬定「論文掛名原則」，詳列什麼狀況最好不要掛名、貢獻程度低者放致謝欄位及可，並考慮引進查核工具，避免類似事件重演。科技部次長林一平也表示，論文互相引用或掛名在學術圈很常見，但過去科技部多只能道德勸說，此次因為教長論文風波引起審查制度的討論，科技部得以擬定新規範，原則上將於此次論文掛名案結束後提出。
另針對前教長蔣偉寧日前請辭下台，江揆17日特別在行政院院會上為他抱屈，表示自己自始至終都對蔣的學術倫理非常信任，但蔣在當時媒體與民間的輿論下，若仍堅持擔任教育部長，恐怕對政策推動不利，因此才同意蔣請辭。
對於蔣偉寧離開內閣團隊，江表示「非常心疼」，「也感到遺憾」；對於有媒體報導稱2人早有不和，江揆再度澄清與蔣私交甚篤，外界不應胡亂臆測。
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